Ионина пустыня существовала еще в XVI веке на северо-западных подступах к Городцу. В 1691 г. рядом с раскольничей часовней на территории пустыни боярыня вдова княгиня Анна Никифоровна Лобанова-Ростовская построила церковь Спаса Нерукотворного Образа с приделами Иоанна Богослова и Алексея Человека Божия. К ней было приписано 40 крестьянских дворов из владений Тихона Никитича Стрешнева, а в 1705 году вдова Анна Никифоровна приписала еще 67 дворов.

В начале 1718 года клир храма просил разрешить перестроить церковь в камне, так как «та церковь Божия деревянная стала быть весьма ветха и впредь будет служить невозможно». Разрешение было дано 19 мая 1718 года митрополитом Рязанским и Муромским Стефаном. Строительство новой каменной церкви велось на средства прихода, работами руководил церковный староста Иван Афонасьев сын Воинов.

Строительство было завершено 3 октября 1745 года. В доношении Балахнинского духовного правления в Московскую Святейшего Правительствующего Синода контору храм описан так: «новопоставленная каменная церковь имеется отстроена не шатровая и по обычаю, как и прочия каменные церкви, и ко освящению тоя церкви иконы все изготовлены». Это был традиционный по композиционному решению храм с трапезной и шатровой колокольней над западным входом. Над четвериком бесстолпного молельного зала возвышался восьмерик с ребристым куполом, завершенным небольшой главкой.

Указ Святейшего Синода об освящении церкви Нерукотворного образа Спасова был дан 4 января 1746** года. Храм занимал сравнительно ровную террасу в полугоре и господствовал над окружающей деревянной застройкой, поэтому его доминирующее значение в этой части города как бы фиксировало факт развития его в западную сторону. Церковь сгорела во время сильного пожара 22 июля 1838 года.